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宜宾学院临港校区教师首次获得油樟基因组信息
来源:农林与食品工程学部 发布日期:2024/07/12 点击量:

近日,宜宾学院临港校区农林与食品工程学部严宽,四川省油樟工程技术研究中心主任魏琴等教师的学术论文《Chromosome genome assembly of the Camphora longepaniculata (Gamble) with PacBio and Hi-C sequencing data》(《油樟染色体基因组组装与注释》)在《Frontiers in Plant Science》(《植物科学前沿》)上在线发表。

该研究对油樟基因组进行测序、组装和注释。结果表明,油樟基因组大小为702.29 Mb,重复序列占比约为60.39%;经初步组装和质量评估,三代测序片段回比到基因组的比对率为99.62%;BUSCO基因集中能完整比对到单个基因的占比为94.49%。在油樟基因组中预测到的基因数量为39,173个,其中有36,632个基因被注释到功能,占基因集总数的93.51%。这说明本研究获取了高质量的油樟基因组,这是油樟基因组信息首次被获得。该研究为中国特有香料植物资源油樟进一步的分子育种等研究提供了关键性基础数据。

严宽副教授为成果的第一作者,魏琴教授、外籍教师Ahmed H.El-Sappah博士和兰州大学汝大福博士为共同通讯作者。

该研究得到宜宾市科技局项目,宜宾学院临港校区校级项目基金的支持。

(供稿/杨丽 审稿/郭鹏 终审/张青 编辑/王颖 制作/幸雁)